Im Februar 2006, vier Monate vor Veröffentlichung von Superman Returns, kündigte Warne Bros. bereits einen weiteren Teil für Mitte 2009 an, bei dem Bryan Singer ebenfalls Regie führen sollte. Auch die Darsteller Brandon Routh, Kate Bosworth, Kevin Spacey, Sam Huntington, Frank Langella und Tristan Lake Leabu sollten wieder mit dabei sein. Doch Singer lehnte das Angebot ab, um sich um die Neuverfilmung von Flucht ins 23. Jahrhundert zu kümmern.

Autor Michael Dougherty wollte eine actiongeladene Fortsetzung mit weiteren Kryptoniern. Auch Brainiac und Bizarro sollten zu sehen sein. Die im Weltall herumfliegende "neu-kryptonische" Landmasse aus Superman Returns wäre der Einstieg für eine Fortsetzung gewesen. Obwohl Superman Returns überwiegend positive Kritiken erhielt, waren Warner Bros. und Legendary Pictures mit dem Einspielergebnis unzufrieden. Warner-Präsident Alan F. Horn sagte: "Wir wollten 500 Millionen Dollar einnehmen. Vielleicht hätten wir dem jungen männlichen Publikum etwas mehr Action bieten sollen."

Bryan Singer reagierte ungehalten: "Der Film hat 400 Millionen Dollar eingespielt! Ich weiß nicht, was man heutzutage erwartet.". 175 Mio. US-Dollar wollte man für das Sequel ausgeben. Superman Returns verschlang seinerzeit 209 Mio. US-Dollar.

Der Drehstart war für Mitte 2007 geplant, ehe Singer durch seine Arbeit an Operation Walküre - Das Stauffenberg-Attentat aufgehalten wurde. Die Arbeiten wurden auf März 2008 verschoben, doch die Autoren Dougherty und Dan Harris verließen das Projekt, um sich anderen Aufgaben zu widmen. Durch einen Autoren-Streik zwischen November 2007 und Februar 2008 war man gezwungen, den Starttermin auf 2010 zu verschieben. Bryan Singer plante dennoch, im März 2008 mit den Arbeiten an der Fortsetzung zu beginnen. Hauptdarsteller Brandon Routh ging von einem Drehstart im Frühjahr 2009 aus.

Doch Warner Bros. entschied sich schließlich für einen Reboot der Superman-Reihe. Daraufhin verließ Bryan Singer das Projekt. Warners Produktionspräsident Jeff Robinov erklärte daraufhin, man wolle Superman unabhängig von einem Batman/Superman-Film neu positionieren. Im Juni 2008 begannen schließlich die Arbeiten an Man of Steel. Im Oktober 2010 gab Warner Bros. bekannt, dass Zack Snyder Regie führen wird.